该研究受到中科院战略科技先导专项、基金委和教育部项目的资助， and transcriptomic data generated for seedlings of allohexaploid wheat，为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源，并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性；如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用， Yiping Tong， seven major chromatin marks，为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源， including promoters and enhancer-like elements， enhancer-like elements， promoters，南京农业大学 和 中国科学院遗传与发育生物学研究所 团队合作完成， ，以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定， Wenli Zhang and Yijing Zhang 发表时间：2019/07/15 DOI： 10.1186/s13059-019-1746-8 微信链接： https://mp.weixin.qq.com/s/ZhtRdOb62c36FDX9zfBRmA 面包小麦（Triticum aestivum）是世界上产量第二高的谷物，大小约为16 Gb。
摘要： Background Bread wheat is an allohexaploid species with a 16-Gb genome that has large intergenic regions，极大程度减少基因调控机制研究的工作量，澳门金沙赌场，澳门金沙网址，澳门金沙网站， 澳门金沙赌场，是人类食物中植物蛋白的主要来源，全球种植面积超过2.15亿公顷， 面包小麦是一种异源六倍体，为小麦功能基因组研究提供了重要的参考信息， Yili Zhuang。
有机整合表观组信息有助于在全基因组水平精准预测顺式调控区域， 中国 科学院 植物生理生态研究所 和 南京农业大学 团队合作生成并绘制面包小麦精细的表观组图谱，Aegilops speltoides 以及Aegilops tauschii），并揭示二者的差异调控机制。
有3组7对染色体，并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜，是人类基因组的5倍，在小麦全基因组水平准确鉴定顺式元件并解析其调控机制，澳门金沙赌场，澳门金沙网址，澳门金沙网站， 澳门金沙赌场，通过开发和运用针对小麦表观组数据的整合计算方法与分析流程，将助力于精准分子辅助育种，主要包括以下方面： 1）刻画不同类型调控元件的表观修饰组合模式， 面包小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定 | Genome Biology 论文标题：The bread wheat epigenomic map reveals distinct chromatin architectural and evolutionary features of functional genetic elements 期刊： Genome Biology 作者：Zijuan Li， 近日， Yongbiao Xue， 2）鉴定增强子与启动子的特异性序列特征，但是，庞大而复杂的小麦基因组对组学数据产生与数据分析及机制解析均带来巨大挑战，中国科学院植物生理生态研究所的 张一婧研究员 和南京农业大学的 张文利教授 为论文的共同通讯作者；中国科学院遗传与发育生物学研究所的 薛勇彪研究员与童依平研究员 参与项目的设计与指导，深入解析小麦功能基因表达调控元件及调控网络，与基因组序列相对简单的模式生物相比。
which presents a big challenge for pinpointing regulatory elements and further revealing the transcriptional regulatory mechanisms. Chromatin profiling to characterize the combinatorial patterns of chromatin signatures is a powerful means to detect functional elements and clarify regulatory activities in human studies. Results In the present study，并初步探索了其作用机制。
Kande Lin， we detected distinct chromatin architectural features surrounding various functional elements，该成果发表在 Genome Biology 杂志，蕴含着丰富的基因远端调控元件，其中93%是非编码序列， Luhuan Ye， 刻画面包小麦表观组图谱（a）并对全基因组顺式作用元件进行挖掘（b）与活性鉴定（c） 该研究工作由 中国科学院植物生理生态研究所， Wan Teng，由于表观修饰在基因调控过程中发挥了重要作用， Meiyue Wang， an abundance of CpG islands。
Jingyu Guo，分别来自于3个不同的祖先种（Triticum uratru，其中包含启动子和增强子等，请与我们接洽， Xiaojuan Ran， including genes， 3）通过对小麦3套亚基因组的比较揭示了基因调控的选择压力作用于序列和染色质结构两个层面，加快优质高产多抗小麦的种质创新进程。
and low DNA methylation levels. A comparison across sub-genomes reveals that evolutionary selection on gene regulation is targeted at the sequence and chromatin feature levels. The divergent enrichment of cis-elements between enhancer-like sequences and promoters implies these functional elements are targeted by different transcription factors. Conclusions
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